Ma non penso proprio, lol
Anche perché la rom che hai su smartphone è sicuramente quella originale per GB, mentre quella per VC 3DS è leggermente diversa e include le opzioni per il trasferimento wireless 3DS. Se fosse possibile trasferire (e dubito fortemente che lo sia), dovresti usare un emulatore 3DS (che non esiste su smartphone e che su PC è molto difficile che giri) con la ROM 3DS VC di OA (che dubito esista, visto che c'è quella GB molto più semplice da usare), e convincere il 3DS che il tuo emulatore sia una console vera e propria con cui fare scambi.
tl;dr: no.