Ciao, dipende dal gioco che hai e se disponi di strumenti esterni.
Il salvataggio del gioco versione cartuccia, si trova appunto dentro la cartuccia e l'unico modo per estrarlo è usare il power save.
Le copie digitali, invece, salvano dentro la SD, ma non ho idea di come si possa poi fare per rimettere il vecchio salvataggio nel gioco.
Se non vuoi perdere i Pokémon, ti consiglio la banca Pokémon o qualcuno che ti aiuti con gli scambi.