Ciao coetaneo, benvenuto. Penso che devi andare nel tuo profilo. Una volta che ci sei, in alto a destra c'è un pulsante nero "modifica profilo". Dopo che l'hai premuto, guardi in fondo alla pagina la sezione Codice amico 3DS, lì puoi inserire il nome del mii sul 3DS e il codice amico. Poi vabbé, fai "salva modifiche" che è appena lì in basso.
EDIT: ma vedo che l'hai già fatto