Anche un admin ha votato LA
Dove andremo a finire... -fp
(Volca, con te faccio i conti dopo)
La domanda è "quale suona meglio?", non "quale è grammaticalmente corretto?", e fonologicamente mi sembra una cazzata bella e buona sostenere che una consonante sonora seguita da un dittongo separati da una pausa suoni bene, perché costringe l'intero cavo orale a prendere due posizioni diverse.
Poi, sì, grammaticalmente è corretto dire "il wiki", ma è inopinabile che suoni di merda. [e te lo dice uno che ogni volta fa a merda chi nomina "Wii" al femminile, ipocrisia ftw]
EDIT: Ah, e c'è da aggiungere che il termine in Italia è conosciuto per derivazione di "Wikipedia", che però è legittimamente femminile, quindi questo rafforza l'idea nell'immaginario collettivo che "wiki" sia un sostantivo di genere femminile.